Филиал МГУ в Душанбе должен начать свою работу в 2009 году. Указ об его открытии президента Таджикистана Эмомали Рахмон подписал 7 мая 2009 года. Договоренность об открытии в Душанбе филиала Московского госудраственного университета имени Ломоносова была достигнута в ходе официального визита в президента РФ Дмитрия Медведева в августе 2008 года.
Филиал будет функционировать в соответствии с законодательством Республики Таджикистан и Российской Федерации. Прием абитуриентов и аттестация выпускников будут осуществляться в соответствии с требованиями, порядком и сроками, устанавливаемыми МГУ. Министерству финансов Таджикистана дано поручение обеспечить, начиная с 2009–2010 учебного года, финансирование за счет госбюджета.